我认为两者的区别主要有选品范围、头程服务、产品入仓前要求、发货后产品的差评处理、对退货支持、货物存放风险等6个方面的区别
选品范围的差异
亚马逊FBA仓对选品的尺寸、重量、类别有较多的限制，所以选品偏向于体积小、高润好、质量好的产品；海外仓的选品范围比FBA仓的广一些，像体积大、重量大的产品也适合用海外仓。
头程服务的差异
亚马逊FBA仓不会为卖家提供头程清关服务；部分第三方海外仓服务商会给卖家提供头程清关服务，甚至还会有包含代缴税金、派送到仓的一条龙服务。
产品入仓前要求的差异
亚马逊FBA仓的入仓要求较为严格，需要卖家在发货前在处理贴好外箱标签及产品标签，如果外箱或产品标签有破损的话，会要求卖家先整理，然后才能进入FBA仓。且亚马逊也不提供产品装组服务；
第三方海外仓的入库要求不会像亚马逊FBA仓这么高，在上架前会提供整理、组装产品的服务。
发货后产品的差评处理的差异
由FBA所导致的任何中差评，都可以由亚马逊移除，卖家无需操心；如果使用第三方海外仓所引起的中差评，海外仓服务商则不一定能提供售后与投诉服务，即使提供了也不一定能够成功消除客户留下的中差评。一般第三方海外仓很少有因物流派送而引起的差评。
对退货支持的差异
亚马逊是支持客户无条件退换货的，FBA仓对退回的产品不会再进行任何的鉴定，也不会收取买家的任何费用。就算退回来的产品没有质量问题，亚马逊也不次再次将产品售给第二个买家。这样的退货方式其实算是比较偏袒客户的，会导致产生较高的退货率。如果产品被退回，无论是销毁还是寄还卖家，亚马逊会另外收取费用。
如果是第三方海外仓，对退回来的产品，而海外仓的话，如果不是质量问题的话，可以替卖家更换标签或者重新包装，然后再次进行销售，能减少卖家的损失。
货物存放风险的差异
将货物放在海外仓，都潜在安全风险。放置在FBA仓中，其安全与Amazon账号安全相关联。如果你在亚马逊销售的产品出了问题，账号被Amazon关闭的话，那么放在亚马逊FBA仓的货物也会被暂时查封；如果是将存放在第三方海外仓库的话，则不用担心这个风险。
